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家鹅基因组测序获得重要进展
来源: |  日期:2017-4-19 |  阅读:1838

       近日,由国家水禽产业技术体系岗位专家、浙江省农科院畜牧兽医所卢立志研究员发起、负责的鹅基因组项目取得重要进展,深圳华大基因研究院、水禽体系宁波市试验站、杭州试验站等共同完成的论文《The goose genome sequence leads to insights into the evolution of waterfowl and susceptibility to fatty liver》,2015年5月6日在国际权威刊物《Genome Biology》(影响因子10.465) 以全文形式在线发表。
       该项目是继国际鸡、鸭、火鸡基因组后,国际家禽基因组研究工作的又一个里程碑式的进步,给未来家禽的遗传改良以及其他生物学特性的研究工作提供了宝贵的参考资料。
       众所周知,中国是世界第一鹅生产和消费大国,同时也是鹅种资源最为丰富的国家。家鹅在分类上属雁形目、鸭科、鹅属,是人类驯化历史最久远的禽类之一,它不仅草食性强,还具有产肝率高和抗病性强等特点。为从基因组水平揭示有关家鹅起源、驯化及其他重要生物学特性的遗传基础。项目组测定了高达107倍测序深度的全基因组序列,构建了覆盖全基因组98%以上、Scaffold总长度为1.1Gb的高质量序列精细图谱。结合基因组注释,预测了16150个蛋白编码基因。
       课题组进一步通过比较基因组学研究发现,鸭和鹅作为鸭科动物,遗传距离较近;鸭、鹅与鸡、火鸡等其他陆生鸟类相比,无论是在基因组结构还是基因家族的功能方面存在较大差异。而且,与陆生的鸡、火鸡等家禽相比,家鹅的抗病性强与其在MHC、Mx和RIG-I等基因间所存在的结构或基因数量差异有关。
       此外,为揭示家鹅产肥肝率高的遗传机制,课题组还对人工填饲与非填饲状态下鹅肝组织细胞的形态进行了观察,并对其组织进行了高通量转录组测序。结果发现,鹅肝脏具有超强不饱和脂肪酸沉积能力可能与其leptin基因的缺失有关。
       该项研究将为今后深入开展水禽重要功能基因的挖掘和利用,基因组指导下的高产、优质、低投入家鹅新品种培育提供全新的科技支撑平台。同时,该研究对今后人类脂肪肝相关疾病的研究也具有重要的参考价值。

文章链接:https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-015-0652-y

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