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利用微卫星标记技术分析太湖鹅保种效果
来源: |  日期:2017-4-19 |  阅读:1774
       为研究国家级太湖鹅保种效果,本研究利用微卫星标记对太湖鹅两个世代群体10个微卫星位点进行遗传多样性鉴定,通过分析世代间遗传差异来检测小群保种情况。以浙江湖州卓旺太湖鹅原种场的两个世代太湖鹅为试验材料,每个世代随机抽取100只个体,群体比例为1:4,公鹅20只,母鹅80只,采取翅静脉采血并提取总DNA。根据GenBank和文献上提供的鹅、部分鸭和鸡的微卫星序列及引物进行筛选,选择核心重复序列多且在鹅品种中具有高度多态性的位点并进行PCR扩增。荧光PCR产物采用AB 3730XL DNA分析仪对PCR产物进行毛细管电泳,检测片段大小信息,并由GeneMaker 2.6.0软件自动生成独立的图谱,根据每个图谱峰值最大处读出该位点各目标片段大小,同时判断纯合子(单峰)或杂合子(双峰),最后生成Excel数据表格。利用Microsatellite-Toolkit软件计算等位基因数,等位基因频率,期望杂合度(Expected Heterozygosity,He)、表观杂合度(Observed Heterozygosity,Ho)、多态信息含量(Polymorphism Information  Content ,PIC)。用Popgene32软件进行哈代-温伯格平衡检验、Nei氏标准遗传距离及相似性分析。运用SPSS17对2个世代间的遗传多样性指标进行差异显著性分析。
       结果显示:太湖鹅2个世代的10个位点共检测到52个等位基因,0世代和1世代分别检测到49和51个等位基因;两个世代的10个微卫星位点的多态信息含量为0.1572-1.0000,两个世代平均多态信息含量分别为0.5117,0.5040;两个世代的期望杂合度和表观杂合度分别在0.1728-0.8007和0.1900-1.0000之间,平均值分别为0.5844,0.5696和0.6500,0.6270,这两个世代在等位基因、多态信息含量、杂合度上差异均不显著。2个世代Nei氏相似性系数为0. 9907 , Nei氏遗传距离0. 0093,世代间的相似性系数极高,遗传距离极低。在10个微卫星位点中,0世代和1世代分别存在6个位点不平衡,哈代-温伯格平衡趋于下降趋势。近交增量为0.078%,近交系数达到2%需要的世代数为25。
       综合各项指标,该保种场保种效果可行。
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